Macedonia znajduje się na styku dwóch głównych stref klimatycznych, śródziemnomorskiej i kontynentalnej.
Okresowo wiatr przebija bariery górskie na północy i południu, przynosząc pogodę drastycznie kontrastową, jednym z przykładów jest zimny wiatr z północy znany jako „Wardarec”.
Zmieniony śródziemnomorski klimat w Macedonii
Występuje w kotlinie Gewgelja – Walandowo i w kotlinach Dojran kierunek Strumica – Radowisz. Również może się poszerzyć na północ do Skopje, wzdłuż biegu rzeki Wardar.
Ten klimat charakteryzuje się długimi suchymi latami i delikatnymi z opadami zimami. Sezony wiosny i jesieni nie są zauważalne. Jesień jest dłuższa i cieplejsza, o tyle wiosna jest krótsza i chłodniejsza. Przeciętna temperatura w najbardziej gorącym miesiącu – lipcu, wynosi około 25˚C. De mir Kapja jest najcieplejszym miejscem w kraju z letnia temperaturą która może osiągnąć do 40˚C. Przeciętna temperatura w najchłodniejszym miesiącu – styczniu jest dosyć wysoka do 3˚C.
Przeciętna roczna ilość opadów deszczy w obszarach ze zmienionym klimatem śródziemnomorskim jest dosyć niska. Przeciętne roczne wielkości opadów wzdłuż rzeki Wardar są zmniejszone o 500 mm, i przedstawiają jeden z najbardziej suchych regionów w kraju. Na drugich obszarach zmienionego klimatu śródziemnomorskiego przeciętna ilość opadów deszczy jest od 600 – 750 mm . Opady śniegu są bardzo rzadkie na tych obszarach.
Klimat górski w Macedonii
Występuje w wysokich górskich rejonach Macedonii. Charakteryzuje się długimi śnieżnymi zimami i krótkimi chłodnymi latami. Wiosna jest zimniejsza od jesieni.
Temperatura klimatu górskiego spada wraz ze ze zwiększeniem nadmorskiej wysokości .Jest to przyczyną , że najniższe temperatury występują w najwyższych częściach gór Szar Planiny. Na przykład ma negatywne przeciętne temperatury cztery miesiące w roku, takie samo podobieństwo jest w innych wysokich górach.
Najzimniejszymi miesiącami są styczeń i luty, a najcieplejszymi są lipiec i sierpień. Jednak może i w ciepłych miesiącach dojść do dużej zmiany klimatu do ochłodzenie temperatury a nawet do opadów śniegu.
Co się odnosi do ilości opadów, rejony o klimacie górskim mają najwyższa roczną ilość opadów w kraju, z dużą ilością deszczu i śniegu ponad 1.000 mm . Ilość opadów zmniejsza się w miarę posuwania się na wschód i we wschodniej części kraju wynosi 600 – 700 mm . Przeciętny okres zatrzymania się śniegu w górach jest od listopada do kwietnia ale na wyższych partiach gór śnieg może pozostać do maja.
Klimat kontynentalny umiarkowany
Jest to najbardziej charakterystyczny klimat dla Republiki Macedonii, ponieważ obejmuje największą cześć Macedonii. Charakteryzuje się dość zimnymi i wilgotnymi zimami oraz ciepłymi i suchymi latami. Wiosna jest chłodniejsza od jesieni.
Występują różnice w średnich temperaturach w rejonach klimatu kontynentalno-umiarkowanego. Przyczyną takiego stanu jest różnica w szerokości geograficznej regionów, wysokość nad poziomem morza itd. Średnia temperatura w lipcu jest najwyższa w kotlinach Owczego Pola, Koczani i Skopje. Średnia temperatura w styczniu jest najniższa w kotlinie Maleszewskiej.
Roczna ilość opadów tak samo się różni i jest w granicach od 490 mm w kotlinie owczopolskiej do 760 mm w kotlinie prespanskiej. Oprócz deszczu i śniegu w tych regionach występują opady gradu.